甜瓜（ Cucumis melo 吉吉影音色情L.）是一种鬈曲的园艺作物，位居十大生果之列。甜中分为薄皮甜瓜和厚皮甜瓜两个亚种吉吉影音色情，各样性丰富。永久的东谈主工选拔导致严重的驯化瓶颈，莳植品种的遗传各样性显耀低于野生种。刻下公开的甜瓜基因组均是莳植类型，在一定进度上戒指了对甜瓜抗性基因及性状相干关节变异的发掘。
半野生型甜瓜821表型。中国农科院供图
近日吉吉影音色情， 《园艺学接头》（Horticulture Research）在线发表了郑果所甜瓜遗传育种与莳植团队和中国农业大学协作发表的接头论文。他们拼装得胜首个半野生型单倍型甜瓜T2T基因组。
甜瓜‘821’是来自印度的半野生种，对甜瓜新德里花叶病毒（ToLCNDV）等多种病害具有抗性。该接头完成了其自交系两个单倍型T2T基因组的拼装，大小分歧为~373 Mb和~364 Mb，包含27，685和27，258个卵白编码基因。
通过基因组相比发现，在11号染色体内基因存在拷贝数变异，其中存在2个自噬基因可能与甜瓜新德里花叶病毒抗性显耀相干。另外，该甜瓜种内存在呼吸跃变和非呼吸跃变类型，是接头果实锻练的理思材料。
基于‘821’的T2T基因组，接头者通过全基因组关联分析检测到1个与果实锻练相干的显耀信号，并轻狂出候选基因CmABA2，其编码一个细胞质短链脱氢酶，参与零散酸的生物合成。
chloe 调教接头提供了高质料半野生的甜瓜T2T基因组，关于发掘甜瓜抗性相干基因和性状校正具有鬈曲兴趣兴趣。
该接头取得了中国农业科学院科技立异工程、国度当代农业产业手艺体系和海南省要点研发考虑）、欧洲接头理事会、和河南省科技攻关项目的资助。
相干论文信息：https://doi.org/10.1093/hr/uhad182